最古老的硬骨鱼是古鳕类(Palaeoniscoidea),由此演化出古内鼻孔鱼类(Choanichthyes)和现代硬骨鱼类主体辐鳍鱼类(Actinopterygii) 。
鱼类的发展经历了泥盆纪的初生时代、中生代的中兴时代 , 到新生代达到全盛时代,成为脊椎动物中的最大类群 。

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