Y染色体可以与X染色体以及自身发生重组要了解DNA交换如何作用于X和Y染色体，我们需要追溯到大约3亿年前（三叠纪开始时，原始哺乳动物刚刚进化出来） 。那时我们的祖先都有两个X染色体，没有Y染色体 。
在某个时候，一对染色体中发生了DNA突变，产生了SRY基因，这就是使胚胎发育为雄性的基因 。发生这种情况后不久，X和Y染色体就停止了重组，从而防止新生的SRY基因被“修复” 。
【xy染色体是男是女 xy染色体是男是女孩】随着时间的流逝 ， Y染色体失去了许多基因，并缩小为我们今天所了解的那个迷你染色体 。发生这种情况的部分原因是，大多数Y染色体上的遗传物质无需进行重组 。
上图：Y染色体是怎么通过缩短进化出来的？越来越短，直至消失？
最早两条染色体一样长，没有XY之分；
其中一条发生突变，产生了SRY基因；
随着时间推移，其他与性别相关的基因（蓝色）聚集到SRY基因周围（根本就是由于单传的原因，跟男性繁殖优势相关的基因就保留下来了，在X染色体上存在因而无关紧要的其他基因就飘走了）；
到今天 ， XY染色体就只有很少的部分能对得上 。
Y染色体上只有大约5％的序列能够与X很好地匹配，并且可以发生重组（也就是说相互交换混合） 。但是Y染色体上剩下的95％的序列需要能够找到重组的“对头” ， 否则它可能会完全消失?。ň拖褚丫染色体的南高加索鼹形田鼠一样） 。
幸运的是，我们的Y找到了一个可以重组的伙伴——自己！
Y染色体内部保有其最重要基因的第二副本 。这些副本以镜像或回文的形式存在，它们从前或从后读取都是一样的（例如，“ABCCBA”） 。而Y染色体可以在自己内部的这些基因之间交换DNA片段 。此第二副本很有用，因为它意味着Y染色体可以与其自身进行重组，以修复可能的错误并生成唯一的新的Y染色体以遗传给后代 。因此，男性传递给儿子的可能是相似但不完全相同的Y染色体 。
但是，这些并不是Y染色体发生的唯一变化 。由于Y染色体的重组的效果比不上“正常”的重组，Y染色体就产生了容易吸收额外DNA突变的倾向，并将这些突变传递给子孙 。
Y染色体吸收了世代之间的额外变化当DNA复制并分裂成新细胞时，复制机制有时会出错 。但幸好我们的细胞具有出色的修复机制，可以捕捉其中的大多数的复制错误 ， 并且几乎所有错误都可以通过重组来解决 。
但是Y染色体因为没有正常的重组伙伴而不同，Y染色体的复制错误无法通过重组形式解决 。这意味着儿子的Y染色体很容易与父亲的Y染色体产生一些差异，也意味着，父亲的Y染色体新产生的一些差异可以n代单传给男性后代 。
如此就可以根据不同地域人群所拥有的突变来了解人类迁徙的历史（因为外迁者会带着原住民的Y染色体独特的突变标记） ， 画出人类迁徙路线图 。
上图：世界主要Y染色体DNA单倍群类型迁徙路线图 。
总结Y染色体确实是祖祖辈辈的父系遗传下来的，可以用作家族谱系分析，这在如今这个商业基因测序如此发达的时代很方便就可以检测和了解自己的祖源 。读者可以到网上搜一下基因检测 ， 一般几百块钱就可以做几十万点位的检测，祖源信息是最标准的报告内容 。
xy是同源染色体还是姐妹染色单体？Xy是同源染色体，不是姐妹染色 。同源染色体的概念是一条来自父方 ， 一条来自母方，并且形态大小相同的两条染色体 。万，虽然它的形态大小不相同 ， 但是它一条来自父方，一条来自母方，确实是同源染色体，它属于异形的同源染色体 。是区分性别的染色体 。姐妹染色单体是以其中的一条染色体为模板复制而来的两条染色体称为姐妹染色单体 。
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